MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis MCLD chromosome

Total Repeats: 21216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017519	GTT	2	6	20	25	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858115
2	NC_017519	GGA	3	9	36	44	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385858115
3	NC_017519	AAT	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
4	NC_017519	ACC	2	6	105	110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385858115
5	NC_017519	AAT	2	6	111	116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
6	NC_017519	TA	3	6	129	134	50 %	50 %	0 %	0 %	385858115
7	NC_017519	ACC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385858115
8	NC_017519	TTA	2	6	237	242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858115
9	NC_017519	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	385858115
10	NC_017519	ATG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858115
11	NC_017519	AAG	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
12	NC_017519	TAA	2	6	383	388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
13	NC_017519	AAC	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858115
14	NC_017519	T	6	6	418	423	0 %	100 %	0 %	0 %	385858115
15	NC_017519	GA	3	6	453	458	50 %	0 %	50 %	0 %	385858115
16	NC_017519	ATA	2	6	499	504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
17	NC_017519	GAA	2	6	522	527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
18	NC_017519	TGAC	2	8	560	567	25 %	25 %	25 %	25 %	385858115
19	NC_017519	AGA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
20	NC_017519	TAA	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858115
21	NC_017519	TGA	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858115
22	NC_017519	AAAAC	2	10	734	743	80 %	0 %	0 %	20 %	385858115
23	NC_017519	TATTT	2	10	761	770	20 %	80 %	0 %	0 %	385858115
24	NC_017519	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
25	NC_017519	TCT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858115
26	NC_017519	AGA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
27	NC_017519	A	6	6	835	840	100 %	0 %	0 %	0 %	385858115
28	NC_017519	TTTTG	2	10	855	864	0 %	80 %	20 %	0 %	385858115
29	NC_017519	TAAA	2	8	874	881	75 %	25 %	0 %	0 %	385858115
30	NC_017519	T	6	6	887	892	0 %	100 %	0 %	0 %	385858115
31	NC_017519	GGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385858115
32	NC_017519	ATTTA	2	10	977	986	40 %	60 %	0 %	0 %	385858115
33	NC_017519	A	7	7	989	995	100 %	0 %	0 %	0 %	385858115
34	NC_017519	TAAAAA	2	12	1009	1020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385858115
35	NC_017519	AAC	3	9	1036	1044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858115
36	NC_017519	TTC	2	6	1049	1054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858115
37	NC_017519	A	6	6	1102	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	385858115
38	NC_017519	A	6	6	1112	1117	100 %	0 %	0 %	0 %	385858115
39	NC_017519	T	6	6	1123	1128	0 %	100 %	0 %	0 %	385858115
40	NC_017519	GAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858115
41	NC_017519	T	7	7	1164	1170	0 %	100 %	0 %	0 %	385858115
42	NC_017519	T	6	6	1206	1211	0 %	100 %	0 %	0 %	385858115
43	NC_017519	AAAT	2	8	1262	1269	75 %	25 %	0 %	0 %	385858115
44	NC_017519	TTTTG	2	10	1276	1285	0 %	80 %	20 %	0 %	385858115
45	NC_017519	T	6	6	1296	1301	0 %	100 %	0 %	0 %	385858115
46	NC_017519	TCA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858115
47	NC_017519	ATAAA	2	10	1397	1406	80 %	20 %	0 %	0 %	385858115
48	NC_017519	ATT	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858116
49	NC_017519	T	7	7	1683	1689	0 %	100 %	0 %	0 %	385858116
50	NC_017519	A	7	7	1700	1706	100 %	0 %	0 %	0 %	385858116
51	NC_017519	TTA	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858116
52	NC_017519	TAT	2	6	1729	1734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858116
53	NC_017519	TC	3	6	1799	1804	0 %	50 %	0 %	50 %	385858116
54	NC_017519	ATT	2	6	2183	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858117
55	NC_017519	TCC	3	9	2213	2221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385858117
56	NC_017519	AAC	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858117
57	NC_017519	TGT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858117
58	NC_017519	AGTG	2	8	2261	2268	25 %	25 %	50 %	0 %	385858117
59	NC_017519	A	17	17	2291	2307	100 %	0 %	0 %	0 %	385858117
60	NC_017519	GAAA	3	12	2308	2319	75 %	0 %	25 %	0 %	385858117
61	NC_017519	ATA	2	6	2378	2383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858118
62	NC_017519	T	7	7	2394	2400	0 %	100 %	0 %	0 %	385858118
63	NC_017519	ATA	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858118
64	NC_017519	GATAA	2	10	2458	2467	60 %	20 %	20 %	0 %	385858118
65	NC_017519	A	6	6	2471	2476	100 %	0 %	0 %	0 %	385858118
66	NC_017519	T	6	6	2497	2502	0 %	100 %	0 %	0 %	385858118
67	NC_017519	AT	3	6	2511	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	385858118
68	NC_017519	AT	3	6	2650	2655	50 %	50 %	0 %	0 %	385858119
69	NC_017519	ATT	2	6	2661	2666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
70	NC_017519	T	6	6	2665	2670	0 %	100 %	0 %	0 %	385858119
71	NC_017519	AAATT	2	10	2676	2685	60 %	40 %	0 %	0 %	385858119
72	NC_017519	TGA	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858119
73	NC_017519	ATT	2	6	2704	2709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
74	NC_017519	TAA	2	6	2739	2744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
75	NC_017519	A	6	6	2808	2813	100 %	0 %	0 %	0 %	385858119
76	NC_017519	CAAA	2	8	2854	2861	75 %	0 %	0 %	25 %	385858119
77	NC_017519	CAA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858119
78	NC_017519	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858119
79	NC_017519	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
80	NC_017519	ATTT	2	8	2944	2951	25 %	75 %	0 %	0 %	385858119
81	NC_017519	AAT	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
82	NC_017519	AAT	2	6	3019	3024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
83	NC_017519	T	6	6	3024	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	385858119
84	NC_017519	T	6	6	3050	3055	0 %	100 %	0 %	0 %	385858119
85	NC_017519	ATA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
86	NC_017519	ATT	2	6	3062	3067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
87	NC_017519	GAA	2	6	3110	3115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385858119
88	NC_017519	ATT	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
89	NC_017519	CTT	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858119
90	NC_017519	TAA	2	6	3169	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
91	NC_017519	TAA	2	6	3187	3192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
92	NC_017519	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	385858119
93	NC_017519	AT	4	8	3216	3223	50 %	50 %	0 %	0 %	385858119
94	NC_017519	AAAT	2	8	3226	3233	75 %	25 %	0 %	0 %	385858119
95	NC_017519	TTG	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858119
96	NC_017519	TAA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
97	NC_017519	TAA	2	6	3381	3386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
98	NC_017519	TTA	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
99	NC_017519	TTTA	2	8	3409	3416	25 %	75 %	0 %	0 %	385858119
100	NC_017519	A	7	7	3455	3461	100 %	0 %	0 %	0 %	385858119
101	NC_017519	AC	3	6	3470	3475	50 %	0 %	0 %	50 %	385858119
102	NC_017519	AAC	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858119
103	NC_017519	AAT	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
104	NC_017519	A	6	6	3602	3607	100 %	0 %	0 %	0 %	385858119
105	NC_017519	ATAA	2	8	3698	3705	75 %	25 %	0 %	0 %	385858119
106	NC_017519	A	6	6	3745	3750	100 %	0 %	0 %	0 %	385858119
107	NC_017519	TGA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385858119
108	NC_017519	A	6	6	3872	3877	100 %	0 %	0 %	0 %	385858119
109	NC_017519	AAT	2	6	3934	3939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
110	NC_017519	ATA	2	6	3996	4001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858119
111	NC_017519	CAA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858119
112	NC_017519	ATT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858119
113	NC_017519	TCA	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858119
114	NC_017519	ATC	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385858120
115	NC_017519	T	6	6	5937	5942	0 %	100 %	0 %	0 %	385858120
116	NC_017519	CTTT	2	8	6047	6054	0 %	75 %	0 %	25 %	385858120
117	NC_017519	CAA	2	6	6074	6079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858120
118	NC_017519	CTT	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385858120
119	NC_017519	T	7	7	6136	6142	0 %	100 %	0 %	0 %	385858120
120	NC_017519	TGATT	2	10	6173	6182	20 %	60 %	20 %	0 %	385858120
121	NC_017519	TCTT	2	8	6228	6235	0 %	75 %	0 %	25 %	385858120
122	NC_017519	A	6	6	6250	6255	100 %	0 %	0 %	0 %	385858120
123	NC_017519	CAAC	2	8	6278	6285	50 %	0 %	0 %	50 %	385858120
124	NC_017519	AAC	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385858120
125	NC_017519	TTG	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385858120
126	NC_017519	AAT	2	6	6615	6620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385858120
127	NC_017519	T	7	7	6651	6657	0 %	100 %	0 %	0 %	385858120
128	NC_017519	A	7	7	6661	6667	100 %	0 %	0 %	0 %	385858120
129	NC_017519	ATCTA	2	10	6669	6678	40 %	40 %	0 %	20 %	385858120
130	NC_017519	T	7	7	6704	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	385858120
131	NC_017519	TA	3	6	6845	6850	50 %	50 %	0 %	0 %	385858121
132	NC_017519	A	6	6	6872	6877	100 %	0 %	0 %	0 %	385858121
133	NC_017519	A	6	6	6991	6996	100 %	0 %	0 %	0 %	385858121
134	NC_017519	TTAAAG	2	12	7005	7016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385858121
135	NC_017519	T	7	7	7207	7213	0 %	100 %	0 %	0 %	385858122
136	NC_017519	AT	3	6	7253	7258	50 %	50 %	0 %	0 %	385858122
137	NC_017519	ACTT	2	8	7259	7266	25 %	50 %	0 %	25 %	385858122
138	NC_017519	TTA	2	6	7280	7285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385858122
139	NC_017519	A	6	6	7353	7358	100 %	0 %	0 %	0 %	385858122
140	NC_017519	T	6	6	7385	7390	0 %	100 %	0 %	0 %	385858122
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